温州雁荡山自古便是佛门圣地。相传十八罗汉中第五位尊者诺讵那于晋永和年间偕弟子东来，率三百弟子居雁荡山修行，后于大龙湫飞锡观瀑、结跏坐化，被尊为雁荡开山之祖。自此，雁荡山被视为三百罗汉道场，梵音缭绕，古刹林立。山麓之间，有一座始建于民国的庵堂——药师庵。

药师庵位于今雁荡镇西北狮子山麓，临104国道，倚白溪老街，山水清幽。庵寺始建于民国廿四年（1935年），由陈净庆等善信倡建，灵岩寺僧净愿支持，初建矮楼五间，中堂供观音。后阮芹英、陈娇容带发修行，增建南北厢房。1951年土改留大殿。“文革”中佛像被毁，尼众还俗。1980年尼释显云入寺住持，募缘重修。1983年尼释显灵继任。1990年代信众重建正殿，供奉药师佛，东设寮房，西供华佗像，诸佛金身庄严。

全庵占地面积约540平方米。2005年前后，甬台温铁路规划涉及该地，药师庵面临拆迁，殿宇一度破旧简陋。然菩萨慈悲，道场不灭，如今庵寺重光，殿堂庄严依旧，仍为一方信众礼佛修行之净地。

药师庵以药师如来十二大愿为本，秉持消灾延寿、济世利人之宗旨，在雁荡山林立的梵宇之间，如一朵素净的白莲，默默绽放，泽被一方。